澳門(mén)港分外港和內港。
外港位于澳門(mén)半島之東面，是為往來(lái)香港之定期客輪上落乘客所專(zhuān)用。內港位于澳門(mén)半島西面，由34個(gè)碼頭組成，貨物之裝卸都在此運作，而內港14號碼頭只供獲本局批準之船只上落乘客。
南舢舨碼頭位于內港8號與9號碼頭之間，供錨泊于內港之船舶上的人員登岸及離岸，且只限持有澳門(mén)居民身份證、葡藉認別證或獲有權限當局批準的人士才可在此登岸及離岸，并應事前向該處的水警稽查分站報備。往內港航道及內港航道均為55公尺寬，兩者之海圖深度都維持3.5 公尺。九澳港位于路環(huán)島之東北面，九澳港包括有油庫碼頭、水泥廠(chǎng)碼頭、集裝箱貨運站碼頭及發(fā)電廠(chǎng)碼頭，往九澳港之共同航道，寬為75公尺。
澳門(mén)在歷史上曾經(jīng)是遠東最繁榮的商埠之一，十六世紀后期到十七世紀前期的一百年間，是澳門(mén)的轉口貿易的全盛時(shí)期，澳門(mén)當時(shí)成為聯(lián)結歐洲、亞洲、拉丁美洲海上絲路貿易大循環(huán)的樞紐。然而鴉片戰爭以后，香港憑借著(zhù)天然良港的優(yōu)勢，以及其他種種歷史和經(jīng)濟的原因，迅速取代澳門(mén)而成為遠東繁榮的貿易轉口港，而澳門(mén)因為自然條件的限制，港口泥沙淤塞嚴重，尤其是海上運輸從帆船時(shí)代進(jìn)入輪船時(shí)代，航運更加不便，澳門(mén)的轉口貿易規模和范圍急劇縮小。
澳門(mén)回歸五年來(lái)，經(jīng)濟持續快速增長(cháng)，多個(gè)大型基建項目相繼動(dòng)工興建。美資、港資和澳門(mén)自己的大型酒店、娛樂(lè )場(chǎng)、會(huì )展中心等建設項目在澳門(mén)半島和氹仔島四處開(kāi)花，澳門(mén)這個(gè)小城到處是一片繁忙的建設景象。另外，據澳門(mén)特區統計暨普查局最新資料顯示，今年第三季度，澳門(mén)零售業(yè)銷(xiāo)售總額為二十二億元，與去年同期相比上升了23%，與上一季度相比上升了4%。經(jīng)濟發(fā)展、銷(xiāo)費增加、大型建筑項目等，這些都使澳門(mén)的港口貨運量大幅提升，急劇增長(cháng)的業(yè)務(wù)量讓這個(gè)只能停泊五千噸以下貨輪的港口空前繁忙。九澳港根據業(yè)務(wù)量大增的需要，興建一個(gè)新的貨輪泊位，于2005年12月破土動(dòng)工。