盡管物流系統是企業(yè)經(jīng)營(yíng)管理系統的一部分，物流信息系統與企業(yè)其他的管理信息系統在基本面上沒(méi)有太大的區別，如集成化加模塊化、網(wǎng)絡(luò )化加智能化的特征，但物流活動(dòng)本身具有的時(shí)空上的特點(diǎn)決定了物流信息系統具有自身獨特的特征。
（一）跨地域聯(lián)接
在物流活動(dòng)中，由于訂貨方和接受訂貨方一般不再同一場(chǎng)所，如處理訂貨信息的營(yíng)業(yè)部門(mén)和承擔貨物出庫的倉庫一般在地理上是分離的，發(fā)貨人和收貨人不在同一個(gè)區域等，這種在場(chǎng)所上相分離的企業(yè)或人之間的信息傳送需要借助于數據通訊手段來(lái)完成。在假期傳統的物流系統中，信息需要使用信函、電話(huà)、傳真等傳統手段實(shí)現傳遞，隨著(zhù)信息技術(shù)進(jìn)步，利用現代電子數據交換技術(shù)可以實(shí)現異地間數據的實(shí)時(shí)、無(wú)縫的傳遞和處理。
（二）跨企業(yè)聯(lián)接
物流信息系統不僅涉及企業(yè)內部的生產(chǎn)、銷(xiāo)售、運輸、倉儲等部門(mén)，而且與供應商、業(yè)務(wù)委托企業(yè)、送貨對象、銷(xiāo)售客戶(hù)等交易對象以及在物流活動(dòng)上發(fā)生業(yè)務(wù)關(guān)系的倉儲企業(yè)、運輸企業(yè)和貨代企業(yè)等眾多的獨立企業(yè)之間有著(zhù)密切關(guān)系，物流信息系統可以將這些企業(yè)內外的相關(guān)信息實(shí)現資源共享。
（三）信息的實(shí)時(shí)傳送和處理
物流信息系統一方面需要快速地將搜集到的大量形式各異的信息進(jìn)行查詢(xún)、分類(lèi)、計算、儲存，使之有序化、系統化、規范化，成為能綜合反映某一特征的真實(shí)、可靠、適用而有使用價(jià)值的信息；另一方面，物流現場(chǎng)作業(yè)需要從物流信息系統獲取信息，用以指導作業(yè)活動(dòng)，即只有實(shí)時(shí)的信息傳遞，使信息系統和作業(yè)系統緊密結合，克服傳統借助打印的紙質(zhì)載體信息作業(yè)的低效作業(yè)模式。